某日，仙子莱拉从达卡魔王手中逃脱，昏迷在树林边被蕾儿的神奇仙子所救，之后加入神奇仙子并跟着就读艾菲城学院。而三妖后被安置在光圣修道院进行感化教育。达卡魔王入侵光圣修道院带走三妖后并收编，命她们为自己寻找秘笈，好解放自己的力量。随着四部秘笈集齐，达卡魔王成功设计虏获蕾儿并将她转变为黑暗蕾儿，欲藉神龙圣火之力启动秘笈力量，…

住在地球花园市的一个平凡女孩“蕾儿”，在因缘之下认识了一位仙子丝黛娜之后，进入魔法仙境的艾菲城学院就读，在那里结交了几位仙子朋友，并共同成立了“神奇仙子”。一开始来自黑云塔学院的三妖后原本主要找神奇仙子麻烦，红山泉学院的男角色也相继出现。蕾儿逐渐发现自己的身世，并得知自己是神龙圣火的守护天女。三妖后自从被逐出黑云塔学院…